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Informationen zum Seminar Stochastische Modelle in der Biologie (SS 2016)

Dozent:

Prof. Dr. P. Pfaffelhuber


Assistenten/Betreuer:

Peter Czuppon, E-Mail: czuppon@stochastik.uni-freiburg.de, Sprechzeiten: Di 9-11, Mi 10-12 und n.V., Raum: 231a

Felix Hermann, E-Mail: felix.hermann@stochastik.uni-freiburg.de, Sprechzeiten: n.V., Raum: 231

 

Termin: Mo 14-16 Uhr (ct)

Ort: Seminarraum 232, Eckerstraße 1 


 Neuigkeiten

  •  Die Liste der vorläufigen Termine wurde überarbeitet. (30.05.2016)

  


 Literatur

 1) Ullah, M. und Wolkenhauer, O. - Stochastic Approaches for Systems Biology:

Dieses Buch können Sie aus dem Netzwerk der Universität unter diesem Link als PDF herunterladen.

 

2) Erdi, P. und Lente, G. - Stochastic Chemical Kinetics:

Ein Exemplar dieser Quelle finden Sie als Präsenzbestand im Semesterapparat des Stochastik-Teils der Bibliothek des mathematischen Instituts. 


 Vorträge
 
Ziel der Vorträge ist es den Teilnehmenden des Seminars eine Einführung in das jeweilige Thema zu geben. Dabei sollten die zentralen Stellen der jeweiligen Thematik ausführlich dargestellt werden. Des Weiteren ist ein Handout mit den wichtigsten Definitionen und Aussagen des Vortrags zu erstellen.
Der Vortrag sollte in etwa 90 Minuten lang sein, wobei er sich ggf. auch über mehrere Sitzungen verteilen kann, d.h. alle angegebenen Termine sind vorläufig.
Es wird erwartet, dass Sie bis auf begründete Ausnahmefälle regelmäßig am Seminar teilnehmen.
Bitte vereinbaren Sie spätestens zwei Wochen vor Ihrem Vortrag einen Termin mit dem Assistenten, um Fragen und Struktur des Vortrags zu besprechen.


 Vorläufige Termine

DatumThemaBetreuer
18.4.2016Stochastic FormulationP. Czuppon
25.4.2016Propensity as a Transition RateF. Hermann
02.5.2016Discrete Stochastic SimulationP. Czuppon
30.5.2016 *Chemical Masters EquationF. Hermann
30.5.2016 *The 2MA-ApproachF. Hermann
06.6.2016 **Outline of the 2MA-ApproachF. Hermann
06.6.2016 **Fluctuations Near InstabilitiesP. Czuppon
13.6.2016Gene ExpressionP. Czuppon
20.6.2016Compartmental SystemsF. Hermann
27.6.2016AutocatalysisP. Czuppon
04.7.2016Enzyme KineticsP. Czuppon

 

* Am 30.5.2016 findet ein Doppeltermin statt, beginnend wie üblich um 14:00 ct.

** Am 06.6.2016 findet erneut ein Doppeltermin statt, beginnend um 14:00 ct.